Como faço para cadastrar um produto que só apareça no Mercado Livre. Ou seja não ficará ativo no meu site mas estará disponível no Mercado Livre.

@Laise Oliveira​ , Como a integração é feita via VTEX, os produtos seguirá a regra que está na VTEX, se não estiver ativo no seu site voce nao consegue enviar ativo para o Mercado Livre.

Mas tem alguma opção para deixar sem estoque no site e ativar o estoque no Mercado Livre? Ou tbm segue a mesma regra?

Voce pode criar uma nova politica comercial. ai quando cadastrar o produto vc adciona ele apenas na política comercial do Mercado Livre. a vantagem aqui é que vc pode ter uma politica de precos exclusivas para esse canal de vendas.

https://help.vtex.com/tutorial/configuring-a-marketplace-sales-policy?locale=en