@Leandro Macedo creio que você poderia considerar ativar um modal para estes produtos frágeis.Único detalhe é que esta atualização de modal não pode ser feita via planilha, apenas manualmente ou via método webservice.
Outra possível alternativa seria criar um estoque específico para estes produtos frágeis e uma nova doca, que teria apenas a transportadora, sem Sedex.
Basta criar um estoque separado e vinculado a uma doca especial para essa categoria e integrar com as transportadoras que você quer, excluindo essas que você não quer que apareça.
Não vejo a necessidade de utilizar modal para este caso.