Não é questão de melhor ou não, hoje um projeto em VTEX IO precisa ser alinhado as expectativas do que o e-commerce vai ter ou não pois há algumas limitações em termos de features que estão sendo resolvidas com o passar do tempo.
Se é um projeto simples, sem nada complexo, você pode se aventurar no IO e tenha certeza que encontrará muitos desafios e tickets com o suporte para conseguir de fato realiza-lo.
Por outro lado o CMS te da toda a liberdade para desenvolver a sua loja, porém temos uma queda na performance comparado ao IO por exemplo.