Como posso configurar "retirada em loja" e "frete gratis" pois quando habilito os dois o frete gratis deixa de aparecer no checkout para o cliente

NĂŁo entendi muito bem o que vocĂȘ quer.

VocĂȘ quer que o retirada em loja seja grĂĄtis?

Caso sim, basta subir a planilha de frete com as faixas de cep com valor absoluto 0.

Nathan, eu tenho frete grĂĄtis pra Sul e sudeste pra pedidos acima 150 reais. Criei a retirada na loja fĂ­sica (sem frete) e quando habilĂ­to a retirada em loja o frete grĂĄtis pra Sul e sudeste deixa de aparecer no check-out para o cliente.

Nunca tive esse problema... sua loja tem o checkout customizado?

opa provavelmente o nome do mĂ©todo de envio estĂĄ igual isso faz com que exiba somente uma forma de acordo com a concorrĂȘncia da VTEX.
sugiro trocar o nome do método, deve resolver!
abçs