Consigo cadastrar no PCI um contrato com a adquirente de cartões para cada CNPJ que emite notas?

Temos dois Centros de Distribuição (cada um com seu CNPJ) que emitirão notas fiscais e farão o despacho de mercadorias e gostaríamos que a transação no cartão já fosse realizada no CNPJ do CD que fará o despacho, para isso teríamos dois contratos com a adquirente. É possível configurar isso na VTEX?

Acredito que seja isso o que precisa:

http://help.vtex.com/pt/tutorial/configurando-contas-alternativas

Obrigado @Nathan Prestes​ , creio que seja isso mesmo. Mas não consegui compreender como eu defino (ou a plataforma) quais CEPs vão transacionar pela afiliação X e outros pela afiliação Y.

Outro detalhe: Essa nova loja que eu crio no License Manager, não acaba virando realmente uma nova loja? Ou no front não muda nada?

Desculpe a ignorância, mas não consegui compreender...