O crawler do Google (google-bot), absolutamente, não encontra as páginas dentro da estrutura do site como deveria. Um site com cerca de 3.000 produtos distribuídos dentro de categorias não são encontrados pelos buscadores. Apenas os que estão nas vitrines da home são rastreados, mas mesmo assim, apenas 3 produtos por carrosel aparecem na auditoria do screaming frog e SemRush.
Verificou se o seu Robots.txt está afetando a exibição dessas páginas para o crawler do Google?
Verifica seu Google Search Console se tem algo a respeito dessa indexação de páginas. Geralmente ele mantém relatórios informando o motivo da não indexação;
Para obter mais informações do sitemap, você pode acessá-lo através do link https://{account}.myvtex.com/sitemap.xml ou se ainda não foi configurado, pode seguir a documentação Store Sitemap<!-- --> by <!-- -->vtex quando sua loja é VTEX IO.
Geralmente este arquivo já é montado automaticamente pela VTEX.
Robots.txt na VTEX também é gerado automaticamente, mas você pode editá-lo. Geralmente você o encontra dessa forma https://www.SUALOJA.com.br/robots.txt