Segue o print da tela para melhor ilustração, este erro ocorre antes de finalizar o pedido. Alguém sabe me dizer o que pode ser feito para correção deste problema?
Já tentou retirar todo o css para ver se não tem nenhuma informação escondida?
Podem ser tipos de frete diferente. Você está usando o V6 ou V5 do checkout?
Já desativou todos os scripts personalizados?
Me parece uma customização no front do seu carrinho pois o normal é apenas 1.... estranho.
Já conversou com a sua agencia?