Oi @iHenrique!
Então, de fato não acredito que haja uma forma de filtrar por sellers white label diretamente, já que o objetivo desse tipo de seller é justamente que ele não seja visível no front do marketplace.
Porém, uma funcionalidade de controle de prateleira que a VTEX tem e que funciona bem justamente com sellers white label é a Regionalização. No caso, a separação de produtos na prateleira seria feita não baseado no seller, mas sim na capacidade de entrega para o CEP do cliente. Muitas contas VTEX utilizam sellers white label com pouca ou nenhuma redundância de área de entrega (isto é, cada seller white label entrega em regiões específicas) e portanto dependendo do CEP só apareceriam os produtos de um seller.
Aqui temos uma discussão anterior da Community sobre como implementar essa funcionalidade: Como configurar Regionalization no VTEX IO? - #7 by agvedotti