Isso é (mais uma) limitação da VTEX. Os produtos e SKUs nao podem ser excluidos, apenas inativados. Com o tempo sua base vai ficando toda "suja" até você ser obrigado a limpar tudo.
Ainda não achei um tutorial sobre a limpeza de base, especialmente para você salvar da destruição o trabalho correto. Alguém tem isso?
Esse foi justamente o problema. Eu importei todos os produtos do meu ERP, pensando que seria a forma mais ágil e menos (re)trabalhosa de colocar todo meu estoque online. Ledo engano. A agencia nunca entendeu como nosso sistema comercial funciona e hoje eu tenho problemas para subir qualquer tipo de produto. Contratei uma pessoa apenas para cuidar de VTEX e a confusão continuou mesmo assim. Hoje perco mais da metade do meu dia, todos os dias, para resolver problemas relacionados a esse cadastramento erroneo de produtos. Logicamente, nenhum dos meus funcionários envolvidos no processo conseguiu desvendar os "mistérios da vtex". A última esperança é ler o que a comunidade trás, pq o help costuma estar desatualizado, ou errado ou incompleto.