Sim. O desconto é aplicado no momento que a compra é feita pelo convidado da lista, e o organizador da lista recebe o valor final da compra (c/o desconto aplicado) somado ao valor do frete.
Ex:
Valor do produto = 100,00
Desconto aplicado para o coprador convidado = 20,00
Valor do frete = 10,00
Crédito para o Organizador da Lista = 100,00 - 20,00 + 10,00 = 90,00