@Telione Jesus você terá que criar arquivos diferentes, mantendo o mesmo cabeçalho. Algo que faço nestes casos é criar uma coluna temporária A, com uma numeração sequencial das linhas, 1,2,3...1000. Assim você pode filtrar pelos resultados e colar somente os 1000 em cada arquivo.
Ok Eduardo vou tentar desta forma. muito obrigado !