Olá @Mateus Maia
Isso é configurável, vocês que decidem se utilizará o pagamento do marketplace ou do seller.
Segue alguns artigos que explica sobre a integração de VTEX com VTEX:
http://help.vtex.com/pt/tutorial/vtex-network
http://help.vtex.com/tutorial/configurando-marketplace-entre-lojas-vtex
@Juliana Andrade desculpa reviver este tópico, mas tem uma dúvida que não encontrei em nenhum lugar.
se por um acaso o cliente fizer uma compra de um produto do seller e outra do marketplace, como funciona o pagamento nesse caso? é por prioridade ou sempre será assumido pelo marketplace?
e quanto ao frete? a mesma regra de aplica?