Você diz a limpeza de cache dos arquivos css e js? Caso sim, após subir os arquivos, entre no subtemplate onde está sendo inserido a chamada do arquivo e salve-o.
@Nathan Prestes me refiro a qualquer alteração: inserir produto, alterar configurações no cms, tudo leva horas para aparecer de fato no site.
Há várias etapas para a VTEX conseguir indexar um produto:
http://help.vtex.com/pt/tutorial/entendendo-o-funcionamento-da-indexacao