Tenho a opção retira na loja, gostaria de saber se temos como incluir no fluxo depois de pagamento aprovado a opção de produto disponível pra retirar

É possível fazer isso através de uma middleware (customização por fora da vtex) + trigger da vtex.

Mas, alterar o fluxo sem nenhuma customização, não é possível.

Porém, o que pode ser feito, como alternativa, seria ajustar um dos e-mails que são enviados após o pagamento aprovado para, caso seja de retirada na loja, ter uma mensagem especifica de acordo com o que deseja, assim, não vai precisar mexer no fluxo e nem de customizações externas.